Uramba Bahía Málaga alberga una inmensa variedad de especies de fauna y flora, tanto continentales como marinas. Esto respalda la teoría que establece que este es un refugio Pleistoceno e incluye el área en la lista de puntos calientes de conservación de la naturaleza en todo el mundo. La bahía es reconocida en todo el mundo como un lugar de migración estacional para la ballena jorobada, Megaptera novaeangliae, que llega a las cálidas y tranquilas aguas de la bahía para criar a sus ballenatos y reproducirse. Esta área protegida es el resultado de la labor coordinada del Sistema Nacional de Parques Naturales de Colombia.